大学院園芸学研究院

プロフィール

広範な植物種を研究対象とした染色体の構造や機能に関する研究を行って、染色体の視点から生物の種分化機構の理解を進めようと考えております。また、FISH解析に基づくゲノム・アセンブリ、品種改良を効率的に行うための育種素材や技術の開発に関して研究を行なっております。

研究キーワード

蛍光 in situ hybridization (FISH) ,ゲノム ,染色体 ,分子細胞遺伝学 ,遺伝育種学

研究分野

ライフサイエンス / 進化生物学 /
ライフサイエンス / 形態、構造 /
ライフサイエンス / 多様性生物学、分類学 /
環境・農学 / 遺伝育種科学 /

経歴

2019年12月

-

現在

千葉大学植物分子科学センター

2018年4月

-

現在

千葉大学園芸学研究科准教授

2008年12月

-

2018年3月

千葉大学園芸学研究科助教

2007年10月

-

2008年11月

ウイスコンシン大学 Department of Horticulture 博士研究員

学歴

2004年4月

-

2007年3月

鳥取大学連合農学研究科（博士課程）

2002年4月

-

2004年3月

鳥取大学農学研究科（修士課程）

委員歴

2022年10月

-

現在

一般財団法人染色体学会常任理事

2012年

-

現在

Chromosome Science 編集委員

2020年11月

-

2022年10月

一般財団法人染色体学会理事

2011年

-

2020年11月

一般財団法人染色体学会評議員

受賞

2021年9月

染色体学会, ベストプレゼンテーション賞
菊池真司福士瑠奈 Rai Amit 平川英樹齊藤和季山崎真巳

2016年

染色体学会, 学会賞
菊池真司

2014年

日本育種学会, 論文賞,Seed formation in triploid loquat (Eriobotrya japonica) through cross-hybridization with pollen of diploid cultivars
菊池真司岩砂美和子小堀亜耶蔦木康徳吉田明弘室田有里西野栄正佐々英徳木庭卓人

論文

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Genome sequencing reveals the genetic architecture of heterostyly and domestication history of common buckwheat.

Jeffrey A Fawcett Ryoma Takeshima Shinji Kikuchi Euki Yazaki Tomoyuki Katsube-Tanaka Yumei Dong Meifang Li Harriet V Hunt Martin K Jones Diane L Lister Takanori Ohsako Eri Ogiso-Tanaka Kenichiro Fujii Takashi Hara Katsuhiro Matsui Nobuyuki Mizuno Kazusa Nishimura Tetsuya Nakazaki Hiroki Saito Naoko Takeuchi Mariko Ueno Daiki Matsumoto Miyu Norizuki Kenta Shirasawa Chengyun Li Hideki Hirakawa Tatsuya Ota Yasuo Yasui

Nature plants 2023年8月

Common buckwheat, Fagopyrum esculentum, is an orphan crop domesticated in southwest China that exhibits heterostylous self-incompatibility. Here we present chromosome-scale assemblies of a self-compatible F. esculentum accession and a self-compati...

Organ-enriched gene expression during floral morphogenesis in wild barley.

Gang Chen Kohei Mishina Qi Wang Hongjing Zhu Akemi Tagiri Shinji Kikuchi Hidenori Sassa Youko Oono Takao Komatsuda

The Plant journal : for cell and molecular biology 2023年8月

Floral morphology varies considerably between dicots and monocots. The ABCDE model explaining how floral organ development is controlled was formulated using core eudicots and applied to grass crops. Barley (Hordeum. vulgare) has unique floral mor...

Development and chromosomal characterization of interspecific hybrids between common buckwheat (Fagopyrum esculentum) and a related perennial species (F. ‍cymosum)

Mari Sugiyama Miyu Norizuki Shinji Kikuchi Yasuo Yasui Katsuhiro Matsui

Breeding Science 2023年

Genome-Wide Analysis of Snf2 Gene Family Reveals Potential Role in Regulation of Spike Development in Barley

Chen G Mishina K Zhu H Kikuchi S Sassa H Oono Y Komatsuda T

Int. J. Mol. Sci. 24(1) 457 2022年12月 [査読有り]

Chromosome-scale genome assembly of Glycyrrhiza uralensis revealed metabolic gene cluster centred specialized metabolites biosynthesis

Rai A Hirakawa H Rai M Shimizu Y Shirasawa K Kikuchi S Seki H Yamazaki M Toyoda A Isobe S Muranaka T Saito K

DNA Research 29(6) dsac043 2022年12月 [査読有り]

MISC

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ソバ・ゲノム・プロジェクト-その概要と展望-

大田竜也 FAWCETT J. 竹島亮馬菊池真司大迫敬義白澤健太法月美悠松井勝弘矢崎裕規木曽映里藤井健一郎原尚資 JONES Martin K. 平川英樹 LI Cheng-Yun 安井康夫

育種学研究 25 2023年

孤児作物のゲノム遺伝学およびその展望

大田竜也 FAWCETT Jeffrey A. 竹島亮馬菊池真司大迫敬義白澤健太法月美悠松井勝弘矢崎裕規小木曽映里藤井健一郎原尚資 JONES Martin K. 平川英樹 LI Cheng-Yun 安井康夫

日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 25th 2023年

マルチオミクスに基づくアプローチで植物の特殊代謝物の進化を探る

RAI Amit HIRAKAWA Hideki NAKABAYASHI Ryo KIKUCHI Shinji HAYASHI Koki RAI Megha TSUGAWA Hiroshi MORI Tetsuya YAMAZAKI Mami SAITO Kazuki

質量分析総合討論会講演要旨集 69th 2021年

ラン科エピデンドラムの2n配偶子形成機構の解析

近藤悠出口亜由美菊池真司三吉一光

育種学研究 23 2021年

アルカロイド生合成及び多様化の進化を理解するための比較ゲノミクス

RAI Amit NAKABAYASHI Ryo HIRAKAWA Hideki TSUGAWA Hiroshi NAKAYA Taiki MORI Tetsuya TAKAHASHI Hiroki KIKUCHI Shinji SAITO Kazuki SAITO Kazuki YAMAZAKI Mami

日本植物生理学会年会(Web) 60th 2019年